在荧光定量 PCR(qPCR)技术中,qPCR 扩增曲线与 Ct 值(或Cq值)是理解和分析实验结果的核心要素。它们就像一把钥匙,为我们解锁基因表达量的秘密,在生命科学研究和临床诊断等领域发挥着至关重要的作用。
qPCR通过荧光染料或探针与扩增的双链DNA结合,产生荧光信号。机器实时监测荧光信号变化,反映DNA扩增的数量。通过分析荧光信号的强度,可以定量分析样品中的目标基因。PCR指数扩增过程当中,产物量与循环数之间的关系是:扩增产物量f(x)=起始模板量S×(1+E)^循环个数n。
2、什么是扩增曲线
定义:扩增曲线是描述PCR动态进程的曲线,以循环数为横坐标,以反应过程中实时荧光信号强度为纵坐标。扩增曲线可以分成四个时期:基线期,指数期,线性期,平台期。
扩增曲线常以线性图谱和对数图谱两种形式展现。
线性图谱:以 PCR 循环数为横坐标,荧光信号强度为纵坐标,直接呈现荧光信号随循环数增加的变化情况。
对数图谱:以 PCR 循环数为横坐标,荧光信号强度的对数为纵坐标,突出指数增长期的特征,此阶段曲线会呈现为一条直线。
对数图谱
线性图谱
2、什么是CT值(Cq值)
定义: PCR扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定的荧光阈值时的所对应的扩增循环数(Cycle Threshold)。C代表Cycle,T代表Threshold。
阈值(threshold):在扩增曲线的指数增长区域内,选择任意适当位置设定的荧光检出界限。
荧光阈值一般由仪器自动设置,也可以手动设置。荧光域值阈值线的缺省设置通常是PCR扩增前3-15个循环的荧光信号标准偏差的10倍。
同一次反应中对于不同的基因可单独设置阈值,但对于同一个基因扩增一定要设置相同的阈值。
3、为什么要有CT值
3.1Ct值具有重现性:同一模板不同时间扩增或同一时间不同管内扩增,得到的Ct值是恒定的。
注:模板为10^5k拷贝GAPDH,用GAPDH引物扩增。96个孔重复结果的Ct平均值为19.1,变异系数(Cv)=0.002. 3.2Ct值与起始模板的线性关系:由于Ct值与起始模板的对数存在线性关系,可利用标准曲线对未知样品进行定量测定。
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动物饲养、疾病造模、行为学检测、心功能、无创血压、血常规、全自动生化检测等
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CCK8/MTT、原代细胞分离、流式细胞实验、细胞划痕、侵袭、迁移、EDU染色、转染、稳定株
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PCR检测、荧光定量PCR、绝对定量PCR、端粒酶长度、pull down、双荧光素酶、SSR、SNP检测等
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5. 病理实验
HE染色、免疫组学、电镜
6. 生理生化实验
肝肾功能、抗氧化、免疫反应等生理免疫指标;动植物营养指标、微量元素、重金属、酶活等。
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