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一文拯救 WB 实验!Western blot 内参选择避坑全攻略

浏览:232 发表时间:2025-09-04

一、常见的内参抗体

  

1.β-actin(42 kDa)

特点:β-actin 是细胞骨架的重要组成部分,广泛存在于大多数细胞和组织中,其表达相对稳定,且与众多目标蛋白的分子量差异较大,便于在 Western blot 实验中区分。

局限性:在肌肉组织中,β-actin 的高表达可能影响内参的准确性。此外,其聚合状态易受细胞信号转导的影响,从而导致表达水平发生变化。因此,在肌肉组织相关研究或涉及细胞信号转导的实验中,建议优先选择其他内参抗体,如 GAPDH 或 β-tubulin。


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2.GAPDH(36 kDa)

特点:GAPDH 参与糖酵解等代谢过程,其在多数细胞和组织中表达较为稳定,且与多数目标蛋白的分子量差异较大,便于在 Western blot 实验中区分。此外,GAPDH 的价格适中,是常用的内参抗体之一。

局限性:在特定条件下,如缺氧等,GAPDH 的表达可能会发生改变。此外,若研究涉及糖代谢相关领域,GAPDH 的表达变化可能会影响内参的准确性。在这种情况下,建议选择 β-actin 作为替代内参抗体。


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3.β-tubulin(55 kDa)

特点:β-tubulin 是细胞微管结构的重要组成部分,其表达相对稳定,能够与不同分子量的目标蛋白区分,适用于细胞骨架相关研究。

局限性:β-tubulin 的稳定性可能受到药物处理或细胞生理状态的影响。在某些特殊细胞类型或疾病模型中,其表达可能不稳定。因此,在这些情况下,GAPDH 可能是更好的选择。


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二、如何选择内参抗体

  

1.目的蛋白分子量大小

在选择内参抗体时,应确保目的蛋白与内参蛋白的分子量相差至少5 kDa,以避免在Western blot实验中出现条带重叠,从而确保实验结果的准确性和可读性。


2.目的蛋白的细胞定位

①胞浆和全细胞蛋白:可选择β-actin(42 kDa)、GAPDH或β-tubulin。其中,β-actin在胞浆中表达高效且稳定,但理论上在细胞核内不表达,因此不能作为核蛋白的内参。

②胞核蛋白:可选择PCNA(GB12010)、Histone H3(GB11102)等,这些蛋白在细胞核中表达稳定,适合作为核蛋白的内参。

③核膜蛋白:可选择Lamin B1(GB111802),其在核膜中表达稳定,适合作为核膜蛋白的内参。

④线粒体蛋白:可选择COXIV(GB11250)、VDAC1(GB121939)等,这些蛋白在线粒体中表达稳定,适合作为线粒体蛋白的内参。


3.组织特异性

在脂肪组织中,β-actin的表达量较低,不适合作为内参抗体。

在脑组织中,β-tubulin的表达较高,而β-actin的表达量可能较低,因此建议选择β-tubulin作为内参。

在骨骼肌、心肌和平滑肌中,β-tubulin的表达可能发生变化或特化,而GAPDH的表达相对稳定,因此建议选择GAPDH作为内参。

不同组织和细胞类型对内参蛋白的适用性存在差异。例如:

对于其他来源的样本,如果研究较少,建议参考相关文献报道,选择合适的内参蛋白。


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