导语
在生命科学领域,分子间的相互作用是调控生命活动的核心机制。无论是DNA与蛋白质的“密码对话”,还是蛋白质之间的“协作网络”,都需要通过精准的实验技术来揭示。本文用通俗易懂的语言,带您了解ChIP、荧光素酶报告基因、Co-IP、Pull-down四大技术的原理、步骤和应用场景,助您轻松掌握分子互作研究的核心工具!
一、
ChIP(染色质免疫共沉淀):捕捉DNA与蛋白的“约会证据”
原理
ChIP技术通过甲醛交联“冻结”DNA与结合蛋白的相互作用,利用特异性抗体捕获目标蛋白及其结合的DNA片段,最终通过PCR或测序锁定DNA序列。
应用
研究转录因子结合位点、组蛋白修饰位点等。
实验步骤
交联固定:甲醛处理细胞,固定DNA-蛋白复合物
超声破碎:将染色质切割成200-1000bp片段
免疫沉淀:加入目标蛋白抗体,捕获复合物
解交联纯化:高温去除蛋白,纯化DNA
分析检测:qPCR、测序或芯片分析
注意事项
✔️ 抗体特异性是关键
✔️ 超声条件需优化避免过度破碎
二、
荧光素酶报告基因:基因调控的“信号灯”
原理
将待研究的DNA调控序列插入荧光素酶报告基因上游,通过检测荧光强度反映转录因子对目标序列的激活/抑制效应。
应用
启动子活性分析、miRNA靶标验证等。
实验步骤
载体构建:目标序列克隆至荧光素酶报告载体
细胞转染:与过表达质粒/干扰RNA共转染
裂解检测:加入荧光素底物,测定发光值
数据归一化:通常用海肾荧光素酶作为内参
注意事项
✔️ 设置空载体对照和阳性对照
✔️ 避免细胞密度过高影响转染效率
三、
Co-IP(免疫共沉淀):蛋白质“社交网络”捕手
原理
利用抗体捕获靶蛋白时,与其直接互作的蛋白会被共同沉淀,通过WB验证互作伴侣。
应用
验证体内蛋白质相互作用、复合体组分鉴定。
实验步骤
裂解样本:使用非变性裂解液保持蛋白互作
预清除:用Protein A/G磁珠去除非特异性结合
抗体孵育:加入靶蛋白抗体或对照IgG
沉淀洗涤:收集复合物并洗去杂质
WB验证:检测沉淀物中是否存在互作蛋白
注意事项
✔️ 避免剧烈震荡导致复合物解离
✔️ 设置IgG阴性对照
四、
Pull-down:体外互作的“钓鱼实验”
原理
将诱饵蛋白(如GST标签蛋白)固定在基质上,与“猎物蛋白”溶液孵育,捕获特异性互作分子。
应用
验证直接相互作用、筛选互作蛋白。
实验步骤
诱饵蛋白制备:表达纯化带标签的重组蛋白
基质结合:将诱饵蛋白固定到GST/镍柱
孵育结合:与细胞裂解液/纯化蛋白共孵育
洗脱分析:SDS-PAGE或质谱鉴定结合蛋白
注意事项
✔️ 需设置空载体蛋白对照
✔️ 高盐洗涤减少非特异性结合
技术对比速查表
结语
分子互作技术如同解码生命的“侦探工具”,选择合适的方法需要根据研究目标(体内/体外、直接/间接作用)综合判断。掌握这些技术的原理和操作要点,将为您的课题研究提供坚实的技术支撑!
如有需要,请联系我们~
主营项目
1. 动物实验
动物饲养、疾病造模、行为学检测、心功能、无创血压、血常规、全自动生化检测等
2. 细胞实验
CCK8/MTT、原代细胞分离、流式细胞实验、细胞划痕、侵袭、迁移、EDU染色、转染、稳定株
3. 分子生物学
PCR检测、荧光定量PCR、绝对定量PCR、端粒酶长度、pull down、双荧光素酶、SSR、SNP检测等
4. 蛋白实验
WB、Co-IP、酵母双杂
5. 病理实验
HE染色、免疫组学、电镜
6. 生理生化实验
肝肾功能、抗氧化、免疫反应等生理免疫指标;动植物营养指标、微量元素、重金属、酶活等。
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基因组、转录调控、蛋白组、代谢组、微生物多样性、宏基因组、生信分析
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